La misión del Instituto de Deficiencias en el Desarrollo (IDD) - Centro Universitario de Excelencia es mejorar la calidad de vida y lograr la participación plena de los individuos con deficiencias en el desarrollo en Puerto Rico y en otros países, y de sus familias, a través del ciclo de vida, considerando la diversidad en cuanto a estilos de vida, aspecto cultural y diferencias étnicas.

Esta misión se logra promoviendo que los consumidores de servicios tengan mayor control de sus vidas, que puedan hacer selecciones acertadas, mejorando su productividad, promoviendo su inclusión en todas las actividades de la vida comunitaria y mejorando los servicios profesionales y los apoyos disponibles para esta población.

La misión incluye el interceder por las personas con deficiencias en el desarrollo y sus familias de manera que puedan alcanzar sus sueños y esperanzas.  El personal del IDD intercede en diferentes formas para minimizar las barreras burocráticas y las actitudes que discriminan contra las personas con impedimentos. La labor del IDD está basada en la premisa de que su trabajo tendrá mayor impacto si se fortalece la colaboración con otras agencias y organizaciones para maximizar los recursos para atender los retos que presentan las acciones dirigidas a promover cambios en el sistema para facilitar la inclusión de las personas con impedimentos. Se persigue cumplir esta misión a través de un programa interdisciplinario que considere las competencias de los profesionales en el campo de las deficiencias en el desarrollo.